El Museo del Colegio Nacional de Monserrat nació como un anexo del Museo Histórico de la UNC, formando parte de la contigua exposición de Librería Jesuítica. En el año 2005, este concepto cambió para que el Museo se transformara en una sala independiente, forjando así su propia identidad. Exhibe una importante colección de máquinas de Física, Química y Astronomía adquirida en su mayoría en Francia y Alemania. La colección está compuesta por diferentes instrumentos de todas las ramas de la Física que se estudiaban entre los siglos XIX y XX.